La manipulación genética de las plantas persigue dos grandes objetivos:

1. Aumentar el rendimiento
La biotecnología podría extender las actuales áreas de explotación agrícola, ya que sería posible adaptar las variedades de las especies ya cultivadas a nuevas zonas geográficas con características climáticas extremas, como ocurrió con la introducción del trigo en los países del norte de Europa. También sería posible mejorar la resistencia de los productos a partir de genotipos (conjuntos o partes de la constitución genética de un individuo)resistentes a plagas, enfermedades y condiciones ambientales adversas.

2. Aumentar la calidad
Este objetivo se refiere, sobre todo, el valor nutritivo de los productos. Pero también se podrían domesticar nuevas especies, transformando a especies silvestres en cultivadas con utilidad y rentabilidad para el hombre.