Sus fondos proceden de la colección y la obra del pintor y escultor ecuatoriano Oswaldo Guayasamín. Existe una sala dedicada al arte precolombino y colonial con una colección de arte prehispánico ecuatoriano representativo de diversas culturas. Hay otro espacio que se dedica a obras específicas de Guayasamín, donde aparecen trabajos al óleo, dibujos, obra gráfica y piezas de artesanía y orfebrería diseñadas por el artista. En la planta alta del edificio aparece una sala multiusos y un espacio que recrea el estudio de Guayasamín