El elefante Sebastián y su mejor amiga, Micho, viven en un agradable y pintoresco pueblecito costero, Villasol. ¡Todo el mundo vive feliz hasta que, un día, su estimado alcade JB desaparece! Una tarde, Micho pesca una botella con un mensaje de JB, donde les cuenta que ha naufragado en la Isla Misteriosa y les ruega que vayan a por él. ¡Dentro de la botella hallan también una pequeña simiente que, de la noche a la mañana, se convierte en una pera gigante! Con la pera construirán un barco en el que zarparán Sebastián, Micho y su camarada el Profesor Glucosa. Así empieza esta aventura con piratas peligrosos, un dragón marino y unos fantasmas muy peculiares.

Tendrán que ser valientes, pero nada detendrá a los dos amigos: están decididos a encontrar la Isla Misteriosa y regresar a casa con JB.