La Primera Sala alberga obras de los siglos XIII al XVIII, entre las que cabría destacar las tallas románicas halladas en la ermita del Cristo de Villajos de Campo de Criptana y una espléndida tabla hispano-flamenca de Santa María la Mayor de Alcázar de San Juan. La Segunda Sala está dedicada al Barroco, con lienzos como la Inmaculada de Lucas Jordán y San Jerónimo atribuido a Ribera, y algunas tallas de imaginería de la escuela de Salzillo. En el patio sirve como perfecto espacio para albergar el lienzo de la Inmaculada, de grandes proporciones, que procede de la Iglesia del Hospicio fundado en el siglo XVIII por el Cardenal Lorenzana.