El antiguo convento de los Capuchinos, construido en el siglo XVIII, acoge entre sus paredes la historia de la ciudad. En sus salas podemos recorrer, como en una máquina del tiempo, el periodo prehistórico, el romano o la invasión francesa de Girona. Entre los fondos destaca un mosaico del periodo tardo-romano y un cementerio Capuchino, espacio en el que se momificaban los cadáveres de los monjes más importantes. El museo dedica también una sala a la historia de la sardana, el baile popular de Cataluña.